据所知经混凝沉淀和过滤后的水，虽然其物理外观已符合生活饮用水水质的要求，很大部分细菌、病原菌和其他微生物也得到了去除，但其中还有一定数量的细菌和病原菌存在。
消毒主要杀死对人体健康有害的病原菌和病毒等，保证饮水的卫生安全。我国生活饮用水卫生标准中规定：细菌总数在1毫升水中不超过100个，总大肠菌群1升水中不超过2个。
在工业用水处理过程中，消毒也是防止细菌、微生物对离子交换膜、反渗透膜等的污染的措施，而且有些工业用水也对水有灭菌、除病毒的要求。
那么水的消毒方法很多，其实基本上可分为物理的和化学的两大类。物理方面的有加热至沸腾、紫外线消毒、超声波消毒等方法；化学方面的有氯化消毒、臭氧消毒、重金属离子消毒等方法。
紫外线汞灯有高、低压（按灯管点燃时管内汞蒸气的压力来区分）两种，灯管由石英玻璃制成。紫外线汞灯点燃时放射大量具有杀菌能力的紫外线，同时也放射少量可见光。
利用紫外线进行水消毒，其特点是：接触时间短、杀菌能力强；设备简单、操作管理方便，并能自动化；处理时对水无副作用，无中毒危险。可在处理后水中不允许增加氯离子的小规模工业用水中使用。其缺点是：没有余氯的持续杀菌作用，以及目前我国灯管的使用寿命较短，价格较贵等。
紫外线杀菌器：主要由灯管、镇流器等组成。
